5806 sayılı Karar, 4691 sayılı Teknoloji Geliştirme Bölgeleri Kanununun geçici 2 nci maddesinin üçüncü fıkrası ile 5746 sayılı Araştırma, Geliştirme ve Tasarım Faaliyetlerinin Desteklenmesi Hakkında Kanunun 3 üncü maddesinin ikinci fıkrasındaki gelir vergisi stopajı teşviki kapsamında, bölge ve merkez dışında geçirilen süreler bakımından belirlenen oranın 31/12/2023 tarihine kadar yüzde yetmiş beş olarak uygulanmasını ve 16/10/2021 tarihli ve 4625 sayılı Cumhurbaşkanı Kararının yürürlükten kaldırılmasını düzenlemiştir.
Düzenlemenin Çözdüğü Sorun
Stopaj teşviki, kural olarak personelin bölge ya da merkez içinde geçirdiği çalışma süresine bağlıdır. Uzaktan ve esnek çalışmanın yaygınlaşmasıyla birlikte, dışarıda geçirilen sürelerin teşvik kapsamına ne ölçüde dahil edileceği soru işareti yaratmıştır. Karar, bu sürelere uygulanacak oranı belirleyerek uygulamaya çerçeve çizmiştir.
İşveren Açısından Kritik Takip Başlıkları
- Personelin bölge içi ve bölge dışı sürelerinin ayrı ayrı kayıt altına alınması
- Oranın hangi tarih aralığında hangi düzeyde uygulandığının dönemsel izlenmesi
- Yürürlükten kaldırılan önceki karar dönemine ait hesapların ayrıştırılması
- Teşvikten yararlanan personelin projelere göre eşleştirilmesi
- Ücret bordrosu ile muhtasar beyan arasındaki tutarlılık
İnceleme Sırasında En Çok Sorulan Soru
Vergi incelemelerinde asıl sorgulanan husus, teşvike konu edilen sürenin gerçekten Ar-Ge veya tasarım faaliyetine ayrılmış olup olmadığıdır. Bu nedenle proje bazlı zaman kayıtları, faaliyet raporları ve personel görev tanımları belirleyici hâle gelir. Sadece giriş-çıkış kayıtlarına dayanan bir savunma çoğu zaman yeterli görülmez.
Dönem Geçişlerine Dikkat
Oranın süreli olarak belirlenmiş olması, süre bitiminden sonraki dönem için otomatik devam anlamına gelmez. Dönem geçişlerinde bordro parametrelerinin güncellenmemesi, geriye dönük düzeltme ve fer'i alacak riski doğurur.
Uyum İçin Öneriler
- Zaman takip sisteminizi proje ve mekân bilgisini birlikte tutacak şekilde kurun.
- Her dönem sonunda teşvik hesabını yazılı bir notla belgeleyin.
- Tereddütlü konularda yazılı görüş talep edin ve cevabı arşivleyin.
- Personel değişikliklerini teşvik listesine gecikmeden yansıtın.
Buradaki bilgiler teşvik uygulamasının işleyişine ilişkin genel bir çerçevedir. Oranlar ve süreler yeni kararlarla değiştirilebildiğinden, hesaplama yapılmadan önce yürürlükteki metnin kontrol edilmesi ve ihtiyaç hâlinde mali-hukuki görüş alınması gerekir.